декабрь 1991 — февраль 1993

Министерство науки, высшей школы и технической политики РФ

Салтыков Борис Георгиевич

февраль 1993 — август 1996

Министерство по науке и технической политике РФ

Салтыков Борис Георгиевич

август 1996 — март 1997

Государственный комитет по науке и технологиям РФ

Фортов Владимир Евгеньевич

март 1997 — май 2000

Министерство науки и технологий РФ

Фортов В.Е. (август 1996 — апрель 1998);
Булгак Владимир Борисович (апрель 1998 — сентябрь 1998);
Кирпичников Михаил Петрович (сентябрь 1998 — май 2000)

май 2000 — по настоящее время

Министерство промышленности, науки и технологий РФ

Дондуков Александр Николаевич (май 2000 — октябрь 2001);
Клебанов Илья Иосифович октябрь 2000 — по н/в)